Postdoctorat : décrypter le rôle des macrophages dans la formation de bactéries persistantes aux antibiotiques

Contexte : De nombreux pathogènes sont difficiles à éradiquer, même en l’absence de mécanismes de résistance génétique aux antimicrobiens et alors qu’ils restent sensibles aux antibiotiques in vitro. Une sous-population de bactéries clonales peut résister transitoirement au traitement antibiotique : ces cellules sont appelées persistantes aux antibiotiques. De plus en plus de données suggèrent que l’environnement des cellules immunitaires de l’hôte, en particulier les macrophages, joue un rôle critique dans leur formation. Nous recherchons une personne postdoctorante très motivée pour étudier comment les interactions hétérogènes entre pathogènes et macrophages favorisent l’échappement aux antibiotiques et la persistance, à l’interface de la biologie cellulaire, de l’immunologie, de la microbiologie et de la biologie moléculaire, avec des technologies cellule unique et des approches multi-omiques.

Notre laboratoire : au CIRI, l’équipe Persistence and Single-Cell Dynamics of Respiratory Pathogens dirigée par Nicolas Personnic explore comment l’hétérogénéité, de l’échelle moléculaire à celle des populations, favorise la survie des pathogènes et l’échappement aux antibiotiques. Nous combinons biologie quantitative cellule unique et approches omiques afin de proposer de nouveaux concepts en biologie de l’infection. Vous rejoindrez un environnement dynamique et collaboratif avec accès à des plateformes de pointe.

Profil : doctorat en biologie cellulaire, immunologie ou domaine apparenté, avec un intérêt pour la biologie des macrophages, l’immunité cellulaire, la dynamique des cellules immunitaires ou les interactions hôte-pathogène. Une expérience en imagerie sur cellules vivantes, cytométrie en flux, criblages CRISPR, RNA-seq cellule unique, protéomique ou techniques avancées de biologie moléculaire sera fortement appréciée. Un bon dossier de publications, un goût pour la recherche interdisciplinaire, un esprit d’équipe et d’excellentes compétences de communication en anglais sont attendus. L’éligibilité à des bourses postdoctorales internationales sera un plus.

Les candidates et candidats seront également encouragés à développer des idées indépendantes au cours de leur progression vers l’autonomie scientifique.

Conditions : date de début à convenir. Salaire selon les règles de l’Université Lyon 1 et l’expérience. Poste financé pour 3 ans sous forme de contrats d’un an renouvelables ; la personne recrutée sera accompagnée pour candidater à des financements indépendants.

Contact : envoyer un CV et une lettre de motivation incluant une brève description des intérêts de recherche et de la motivation à rejoindre le laboratoire à [email protected]. Joindre deux lettres de recommandation, dont une de la direction de thèse.

Date limite : les candidatures seront examinées au fil de l’eau jusqu’à ce que le poste soit pourvu.

Publications pertinentes : Dadole et al., Trends in Microbiology, 2024 ; Striednig et al., EMBO Reports, 2021 ; Personnic et al., Nature Communications, 2019.

À propos du CIRI : le CIRI est un institut de recherche majeur affilié à l’INSERM, au CNRS, à l’ENS Lyon et à l’Université Lyon 1. Il rassemble 400 scientifiques aux expertises allant de la microbiologie moléculaire à l’immunologie humaine. Il offre un environnement scientifique stimulant au cœur du Biodistrict lyonnais, avec de forts liens avec la recherche clinique et un accès direct aux plateformes technologiques de la SFR Biosciences. Lyon offre également un écosystème biotech dynamique, une vie culturelle riche et un accès facile aux Alpes, à l’Auvergne, à la Méditerranée et à Paris.