* English version:

A postdoctoral position is available in the laboratory of Dr. Alexandra Naba in the Department of Physiology and Biophysics at the University of Illinois at Chicago.

Dr. Naba’s research uses cutting-edge proteomics to decipher the roles of the extracellular matrix (ECM) in development, health, and diseases. You can learn more about our research here: https://nabalab.uic.edu.

The Naba lab, in collaboration with the Gao lab at UIC has received funding support from the NIH Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP) to build an atlas of the human ECM at the organ and cell levels. We are seeking a highly motivated candidate to join our teams and lead this effort.

Key Responsibilities

  • Analyze, interpret, and integrate multiomic datasets (scRNA-seq, CODEX, proteomics) generated by the Naba lab and contributing members of the HuBMAP consortium
  • Perform data mining of publicly available proteomic datasets as part of the Matrisome Project and MatrisomeDB
  • Work in close collaboration with wet-lab scientists and develop analysis pipelines to support hypothesis-driven research
  • Become an integral member of our research team and contribute to publications and development of open-access resources to advance ECM research

Minimum Qualifications

  • Ph.D. in bioinformatics, computer science, statistics, or related field
  • Familiarity with biological data analysis including single-cell RNA-seq and/or proteomics
  • Strong programming skills (proficiency in either R or Python is a must) and experience working with large volumes of data
  • High accuracy and reliability in the processing of large-scale data and solid understanding of quantitative methods
  • Experience with database management is a plus
  • Collaborative mindset and motivation to work in an international and interdisciplinary environment
  • Excellent written and oral communication skills

To apply, please submit a cover letter, CV including list of publications, and contact information of three references to Dr. Naba.

The application deadline is July 7, 2023 Review of applicants will start immediately. Interviews will take place on a rolling basis and will continue until the position is filled.

Competitive remuneration commensurate to level of experience will be offered. Competitive benefits as well as relocation package may be available, based on eligibility.

 

* Version française:

Un poste postdoctoral est disponible dans le laboratoire du Dr. Alexandra Naba à l’Université de l’Illinois à Chicago.

Notre laboratoire étudie le rôle de la matrice extracellulaire dans différents contextes physio-pathologiques. Pour en savoir plus sur notre recherche, vous pouvez visiter notre site internet: https://nabalab.uic.edu.

Notre laboratoire, en collaboration avec le laboratoire du Dr. Tom Gao  a reçu un financement de 4 ans du NIH Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP) pour contribuer à l’établissement d’un atlas de la matrice extracellulaire des organes humaines avec une résolution sub-cellularie. Nous sommes donc à la recherech d’un(e) candidat(e) motivé(e) pour piloter ce projet.

Responsabilités:

  • Analyse, interpretation et intégration des données multiomic (scRNA-seq, CODEX, proteomics) produite par notre laboratoire et les members du consortium HuBMAP
  • Effectuer l’exploration de données d’ensembles de données protéomiques accessibles au public dans le cadre du projet Matrisome et de MatrisomeDB
  • Travailler en étroite collaboration avec les membres de mon laboratoire et développer des nouvelles méthodes d’analyse pour avancer la formulation de nouvelles hypothèses
  • Devenez un membre intégral de notre équipe de recherche et contribuez aux publications et au développement de ressources en libre accès pour faire avancer la recherche sur la matrice extracellulaire!

Qualifications:

  • Doctorat en biologie avec expertise en bioinformatique, doctorat en biologie computationelle ou statistiques.
  • Familiarité avec l’analyse de données biologiques, y comprisRNA-seq et/ou protéomique
  • Solides compétences en programmation (la maîtrise de R ou de Python est indispensable) et expérience avec de gros volumes de données. Solide compréhension des méthodes quantitatives.
  • Une expérience en gestion de bases de données est un plus
  • Esprit collaboratif et motivation à travailler dans un environnement international et interdisciplinaire.
  • Excellentes compétences en communication écrite et orale.

Pour postuler, veuillez soumettre une lettre de motivation, un CV comprenant une liste de publications et les coordonnées de trois références au Dr Naba.

La date limite de candidature est le 7 juillet 2023. L’examen des candidats commencera immédiatement. Les entretiens se poursuivront jusqu’à ce que le poste soit pourvu.

Une rémunération concurrentielle selon le niveau d’expérience sera offerte. Des avantages compétitifs ainsi qu’un forfait de réinstallation peuvent être disponibles, en fonction de l’éligibilité.

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